引用本文:张卓,江帅,李睿江,李宛莹,李昊,陈河兵,伯晓晨.面向肿瘤精准医学的综合数据资源TCGA及其相关在线分析工具推荐[J].中华医学图书情报杂志,2018,27(3):5-9.
面向肿瘤精准医学的综合数据资源TCGA及其相关在线分析工具推荐
Comprehensive data resource TCGA for oncology precision medicine and its online analysis tools
DOI:DOI:10.3969/j.issn.1671-3982.2018.03.002
中文关键词:  癌症  多组学数据  精准医学  分析工具  肿瘤  基因组
英文关键词:Cancer  Multiomics data  Precision medicine  Analysis tools  Tumor  Genome
基金项目:“精准医学研究”重点专项“精准医学大数据管理和共享技术平台”(2016YFC0901600)
作者单位
张卓 军事科学院军事医学研究院辐射医学研究所北京100850 
江帅 军事科学院军事医学研究院辐射医学研究所北京100850 
李睿江 军事科学院军事医学研究院辐射医学研究所北京100850 
李宛莹 军事科学院军事医学研究院辐射医学研究所北京100850 
李昊 军事科学院军事医学研究院辐射医学研究所北京100850 
陈河兵 军事科学院军事医学研究院辐射医学研究所北京100850 
伯晓晨 军事科学院军事医学研究院辐射医学研究所北京100850 
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中文摘要:
      癌症基因组图谱(TCGA)是一个公共资助的项目,旨在编目和发现引起癌变的主要人类基因组变化,目标是创建癌症基因组的全面“图谱”。TCGA数据库收录了多种癌症组学数据,包括转录组数据、表观遗传组学数据、基因突变数据和疾病样本临床数据等,为认识肿瘤发生的相关知识提供了丰富的资源,可以帮助科研人员更好地学习和认识癌症相关领域知识并促进肿瘤精准医学的实现。调查整理了TCGA数据在线分析工具并对其进行筛选推荐,可以帮助研究人员方便地进行TCGA数据分析。
英文摘要:
      TCGA, a public-funded project, is aimed at cataloguing and discovering the major human genome variations that induce canceration. Its goal is to establish a comprehensive cancer genome atlas. A variety of cancer genomics data are covered in TCGA database, including transcriptomics data, epigenomics data, gene mutation data, and disease sample clinical data, which provide a wealth of resources for understanding the knowledge in relation with tumorgenesis, and can thus help scientific researchers to effectively learn and understand cancer-related knowledge, and speed up the realization of oncology precision medicine. The online analysis tools of TCGA data were assessed in order to help scientific researchers to analyze the TCGA data.
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